俱樂部曆史
球隊創立
1994年1月26日，深圳足球俱樂部在容志行、曾雪麟等人努力下正式挂牌組建，是一家會員制職業足球俱樂部，是廣東省最早成立的職業足球俱樂部之一，以“國内領先、亞洲一流、世界知名”為俱樂部的目标。球隊成立當年在俱樂部首任主教練胡之剛的帶領下，即獲得乙級聯賽冠軍。
1995年，升入中國足球甲B聯賽并獲得當年冠軍。
1996年，于成立第三年升入當時的中國足球頂級聯賽即中國足球甲A聯賽，創造了中國足壇一支球隊從成立到進入頂級聯賽的最快紀錄，憑借“三連跳”的表現創下了足球圈内的深圳速度。但球隊于同年因戰績不佳重新降入甲B。
茁壯成長
1997年，平安保險集團全資收購深圳足球俱樂部，俱樂部冠名為深圳平安，獲得甲B聯賽亞軍，重新得到甲A聯賽晉級資格，從此一直留在頂級聯賽中。
1998年，俱樂部聘請了亞洲足壇名宿、韓國人車範根擔任主教練，車範根是俱樂部首位外籍主教練。1998年底收購火車頭一線隊22名隊員中的14名隊員，其中包括李玮鋒及李毅、鮑文傑、楊光等人。
2000年，5月朱廣滬接替巴西人塔瓦雷斯成為深圳足球隊的主教練，獲甲A聯賽第九名。
2001年，在主教練朱廣滬的帶領下，球隊獲得了聯賽第五名，在此後的數年間深圳足球隊成為了中國足球聯賽的強隊之一。
創造輝煌
2002年，獲得了聯賽亞軍，這是球隊在甲A時代的最佳成績。12月，健力寶集團全資收購深圳足球俱樂部。
2003年，俱樂部更名為深圳健力寶足球俱樂部。擁有李玮鋒、李毅、楊晨、鄭智、鄭斌等國腳，成為當時擁有現役國腳最多的球隊，加上陣中多名外援國腳和本土實力球員，被球迷稱作“皇家健力寶”。
2004年奪得了首個聯賽冠軍，成為首支奪得頂級聯賽冠軍的廣東省球隊，并且獲得了參加2005年亞洲冠軍聯賽的資格。由于2004年甲A聯賽變身中國足球超級聯賽（簡稱“中超”），深圳隊也成為了首屆中超冠軍。
2005年，球隊财政狀況不佳，再加上在隊中地位頗高的主教練朱廣滬被迫離開球隊擔當國家隊主教練，引緻隊内一批主力球員出走，球隊實力大受影響。結果在聯賽中僅列第12名。即便處境艱難，球隊依舊在杯賽中打出了堅韌不屈的深足精神，獲得中超杯亞軍，亞洲冠軍聯賽第三名，創造了深足神話。11月，健力寶集團轉讓深足90%的股權。
逆境拼搏
2006年，球隊獲一家深圳本地知名啤酒企業出資冠名為深圳足球俱樂部金威啤酒隊，這個賽季聘請了王寶山擔任主教練，開始以年青球員為主力，最終以第十一名完成中超。
2007年，球隊獲一家廣州企業贊助，而更名為深圳香雪上清飲足球俱樂部，最終以第十四名完成中超。
2008年，深圳隊幾乎面臨解散最終通過深圳市足協托管而保留下來，在首輪比賽中，深圳隊客戰上海申花，最終以0-2失利，在次輪4月1日次對陣廣州醫藥的南粵德比比賽前，俱樂部宣布麥超下課，原領隊張增群出任代理主帥。7月底請回了前主教練王寶山擔任技術顧問，中超保級成功。另外，自深圳隊創隊後便一直使用的訓練基地——筆架山基地要改造成2011年世界大學生運動會的訓練場館，基地被拆除重建，故深圳隊也搬離這裡。
守護夢想
2009年，17名球員集體罷訓，在深圳市足球管理中心（深圳足協）索要薪水并要求上榜轉會，最終隻獲得“白條”欠薪證明。 1月21日，深圳足球俱樂部正式宣布，香港一外資财團及深圳南山少年足球俱樂部将以收購深足全部股份的方式而成為深足新股東，俱樂部注冊名稱暫為深圳亞旅足球俱樂部。
而深足兩名前隊員範育紅、李遠平分别出任俱樂部總經理兼主教練、助理教練及前主教練路建人出任領隊、守門員教練及新聞發言人，2月時又邀請另一前主教練、甲A時期的人氣教練塔瓦雷斯出任技術顧問兼執行教練，同時請來足壇元老、前國家隊主教練曾雪麟重返深足，擔任球隊的總顧問共同組成新教練組并被視作深足曆史上最弱的教練組。3月28日深穗之戰後，深足總經理兼主教練範育紅宣讀了“關于深圳市足球俱樂部股權轉讓情況的說明”，表示楊塞新持有的全部股份，已在2月下旬正式轉讓給了香港潤迅通信國際有限公司董事會主席丁鵬雲和股東任德章 至此,鬧得沸沸揚揚的深足股權轉讓水落石出。
但在4月14日，丁鵬雲發出《嚴正聲明》表明他不是深足的投資人，深足再次陷入動蕩。
4月21日，廣東健力寶集團持有的深足10%股權成功轉讓，标示 “健力寶”已完全退出深圳足球俱樂部。
7月30日，深足俱樂部宣布主打産品為手機的諾亞信公司以買斷球衣背後廣告的方式而成為深足本賽季首個贊助商，結束半年無贊助商的“裸奔”尴尬。 9月23日，深圳足球俱樂部正式宣布，由俱樂部股東發起成立的紅鑽公司将冠名球隊為深圳紅鑽足球隊，并且成為第一支嘗試實現自創品牌、自主經營、自我冠名的中國職業足球俱樂部。
深圳隊在聯賽間歇期從上海申花打包租借了毛劍卿、巴爾克斯、陳雷三名球員，并簽約曾效力天津泰達被譽為津門鐵衛的佐裡奇，實力獲得很大提升。在主場對上海申花的比賽錯穿球衣因而被中國足協倒扣聯賽積分3分的不利情況下，球隊在聯賽最後10輪取得6勝4平的不敗戰績，完成了保級。
2010年，前貝爾格萊德紅星隊主教練高歌奇與俱樂部正式簽約，成為深足的主教練。5月15日，茅台集團正式成為主冠名商，球隊冠名為深圳茅台紅鑽隊。球隊最終排名第12位保級成功。
外援基倫14場進8球幫助深足完成保級，成為隊内最佳射手，日夫科維奇則以10個助攻榮獲中超助攻王。
2011年，外号“白巫師”的法國名帥特魯西埃成為球隊的主教練。球隊簽下了日本球員卷誠一郎和樂山孝志兩名日本球員，中超聯賽史上首次出現日本外援。
主教練倉卒上任，球隊在聯賽一開始就五連敗，因要讓路大運會，深圳隊要将大部分主場比賽遷到惠州和博羅體育中心進行,球隊經常要在惠州和深圳兩個城市往返。在大運會結束後，深圳隊選擇寶安體育場為球隊的新主場。最終球隊由于戰績不佳在頂級聯賽屹立14年後首度降級。
2012年，深圳紅鑽自1996年以來第一次征戰中國第二級别職業足球聯賽。
在賽季開始前，球隊陣容結構出現較大幅度變動，因球隊陣容變動較大，在2012年中甲聯賽中，僅取得第七名的成績，未能實現俱樂部賽季開始前制定的重返沖超目标。
2013年，深圳紅鑽隊主場取得11勝2平2負的驕人戰績，外援巴巴卡表現出色，連續兩年榮獲最佳射手，球隊最終排名第五。賽季末，小牛投資冠名深圳紅鑽，新賽季球隊将以深圳小牛資本紅鑽隊征戰中甲聯賽，與此同時，前國足隊員李毅接替合約期滿的特魯西埃成為球隊代理主教練。
2014年，深足在世界杯休戰期前半年尚且穩紮穩打，盡管俱樂部累積的拖欠薪水和獎金問題逐漸惡化，并深陷轉讓傳聞中，但仍取得了中上排名并非全無沖超希望。
但俱樂部的轉讓進程由于以往累積的股權亂局和萬宏偉要求保留少部分股份的條件，從5月起就開展卻難以成交，從而使得球員和俱樂部間的欠薪矛盾在随後以一種極端的形式爆發。
2014年7月15日，深圳紅鑽在主場深圳寶安體育場進行的中國足協杯第三輪賽事以0-5慘敗山東魯能，但是賽事焦點卻集中在了深圳紅鑽隊員賽前讨薪事件上。隊員們賽前就因被欠薪而計劃放棄本場比賽，經各方一番緊急溝通後，深足隊員同意參賽，但球員仍以特殊方式表達對欠薪的不滿。
在本場比賽開始前，深足隊員們舉起上面寫道“請求政府足協幫助，球員生活已無法維持，還我血汗錢”的橫幅。在裁判吹響開賽哨後，深足隊員們面向本方的球門默站了足足30秒，以示對俱樂部長期拖欠薪酬的抗議，事後迅速在全國引起熱議。足協也立刻發出工作組到深圳調查并維穩，盡管作出了再不解決欠薪就會遭到扣分以及乃至明年不準予注冊參賽的警告，但仍無助于解開俱樂部本身積重難返的結。
在代表其中一家競購方新到任的副總，亦是深足的老面孔孫剛和教練組的努力下，隻能偶然收到俱樂部通過高利貸等預支手段籌發的基本薪水的球員沒有再出現通過集體罷訓罷賽抗議的情況，但球隊在時常遭遇外援因欠薪拒絕出賽的困難上難保成績理想，不過仍實現了提前保級并盡量攢分以預防足協可能作出的扣分出發，最終以第十名結束了一個場上偶有亮點，場下卻行走于解散邊緣的困難賽季。
2014年12月19日，俱樂部召開記者招待會宣布深圳兆能源酒店供應股份有限公司通過注資的方式獲得俱樂部55%的股權并成為新控股方。同時，俱樂部名稱改為中性的深圳足球俱樂部。
2015年12月13日，深圳足球俱樂部召開新聞發布會，宣布俱樂部新任主教練人選确定為本土名帥唐堯東。
球隊文化
隊名
1994-1995年 Shenzhen FC 深圳足球俱樂部
1996年 Shenzhen Feiyada 深圳飛亞達
1997-1998年 Shenzhen Ping'an 深圳平安
1999年 Shenzhen Ping'an Insurance 深圳平安保險
2000-2001年 Shenzhen Ping'an Kejian 深圳平安科健
2002年 Shenzhen Ping'an Insurance 深圳平安保險
2003-2005年 Shenzhen Jianlibao 深圳健力寶
2006年 Shenzhen Kingway 深圳金威
2007-2008年 Shenzhen Shangqingyin 深圳上清飲
2009年 Shenzhen FC 深圳亞旅足球俱樂部
2009年 Shenzhen Ruby FC 深圳紅鑽足球俱樂部
2010年-2013年11月 Shenzhen Ruby FC深圳茅台紅鑽足球俱樂部
2013年11月-2014年12月19日 Shenzhen Ruby FC深圳小牛資本紅鑽隊
2014年12月19日- Shenzhen FC 深圳足球俱樂部深圳宇恒隊
梯隊建設
2000年，深圳足球俱樂部為了加強梯隊建設決定加大投入，将原來的二隊分成二隊和三隊兩支隊伍。
2003年又組建了U15隊，2004年深足陷入動蕩緻梯隊建設停滞，梯隊合并繼續參加全國U-17聯賽、U-19聯賽。
2007年，深足與保定鴻鹄足球俱樂部簽署梯隊合作協議，建立深足後備梯隊人才基地。
2008年9月深足梯隊以“香雪上清飲”之名征戰2008年－09年香港甲組足球聯賽，深圳隊創造一項記錄就是成為首支同時征戰内地和香港聯賽的球隊。但結果位列榜末而需降級到香港乙組足球聯賽。最終随著降級二隊也退出香港聯賽。
2009年，南山少年足球倶樂部以提供訓練基地及隊員的方式入股深圳隊，南山少年隊的隊員成為深足梯隊的隊員，深足的二、三線隊伍亦代表深圳參加廣東省運會和廣東省中學生運動會。南山青少年俱樂部、前任助教謝育新帶領的鹽田少年隊都作為深足梯隊。但随着範育紅下課、謝育新到廣州市二線隊任職後，深足與兩者的關系發生了重大改變。
2013年，深圳紅鑽授權新鄉市綠茵青少年體育俱樂部成立"深圳紅鑽足球俱樂部後備人才訓練基地"。開展U系列梯隊訓練和組建。2013年，與陳永強足球培訓班合作開展青少年足球培訓工作。
2013年，與前外援馬裡科與同樣曾效力深足的日科夫一起攜手深圳紅鑽俱樂部，合作成立了“深圳紅鑽足球俱樂部馬裡科+日科夫青少年足球培訓班”。
深足總裁曾震宇表示将建立青訓
球隊榮譽
欠薪風波
2014年 7月15日，深圳紅鑽隊球員在賽前打出讨薪橫幅。當日，在2014中國足協杯第三輪比賽中，深圳紅鑽主場上演讨薪大戲，且比賽過程中有數人受傷離場，使得對手魯能“不忍下手”進攻，最終以5比0“小勝”深足。據悉，由于工資得不到支付，深圳紅鑽隊的球員們直至賽前才最終決定出場比賽，有傳言說俱樂部在賽前給大家發了欠條。賽前，隊員們手持“還我血汗錢”的橫幅登場，開場後全隊還放棄進攻，面向本方球門進行了30秒的抗議。
2014年10月中旬，俱樂部已經發放了部分拖欠的薪水，8名向足協申請仲裁的球員收到了接近欠薪總額一半的薪水，其中包括2013賽季被拖欠的全部獎金和兩個月的津貼，而未提出仲裁申請的球員則收到了一個月的工資和去年被拖欠的獎金，俱樂部還向隊員們承諾2014年10月24日之前解決全部欠薪。
2014年10月24日，深圳紅鑽俱樂部兌現了此前的承諾，于當天下午向8名仲裁勝訴球員補齊了全部的欠薪，雙方随即簽署了《調解協議書》，沸沸揚揚的紅鑽欠薪風波暫時告一段落。而對于另一部分放棄仲裁申請的隊員們而言，這并不是一個皆大歡喜的結果，因為他們的薪水至今依舊處于被拖欠的狀态，總經理李虹表示，俱樂部對此表示歉意，并會積極籌措資金、解決所有球員的欠薪問題。
