历史沿革
1982年，广东省深圳市与香港特别行政区双方达成协议，共同开辟皇岗至落马洲的过境通道。
1985年5月，皇岗口岸动工兴建。
1988年11月30日，经中华人民共和国国务院批准，皇岗口岸对外开放。
1989年12月29日，皇岗口岸货运部分启用通车。
1991年8月8日，皇岗口岸客运部分开通使用。
1994年11月3日，皇岗口岸开辟两条货检通道试行二十四小时通关，并设置了空车验放专用通道。
1997年3月20日，皇岗口岸开通皇岗—落马洲穿梭巴士服务。
1999年10月，皇岗口岸实行货车自然分流通关。
2003年1月27日，皇岗口岸实行旅检通道24小时通关。10月8日，皇岗口岸允许持有文锦渡、沙头角口岸两地牌的私家车、公务车和商务车在零时至6:30时出入境。
2006年，皇岗口岸改造工程项目立项。
2007年3月，皇岗口岸进行改造工程。
2011年7月，皇岗口岸出境区域“车港城”改造竣工并启用。
2016年1月，皇岗口岸重建专项研究完成招标。
2017年9月29日，皇岗口岸出境大厅新建的自助查验通道竣工，并投入使用。
2018年7月9日，皇岗口岸入境大厅启用新的自助通关备案信息采集点。13日，皇岗口岸出入境小（客）车查验场地启用LED显示屏。
2022年1月1日零时，深圳皇岗口岸迎来RCEP协定生效后全国首票进口货物。
区位环境
位置境域
皇岗口岸位于中国广东省深圳市福田区南端，与香港特别行政区新界落马洲隔河相望，口岸南面的皇岗—落马洲大桥横跨深圳河连接深港两地。西距福田红树林生态公园、福田口岸分别为3.5千米、1千米，东距皇岗海关700米。
建筑规模
建筑结构
皇岗口岸分监管区、生活区、商业服务区；其中，区域监管区分东、西两个场地，东场为货检场地，西场为客车和旅检场地。货检场东侧为入境查验场，西侧为出境查验场；旅检大厅东西向排列，东侧为入境大厅，西侧为出境大厅，大厅两侧为客车通道。
设计参数
皇岗口岸分区域占地面积101.6万平方米，其中监管区65.3万平方米，生活区6.8万平方米，商业服务区29.5万平方米；口岸设计通过能力为每日车辆5万辆次（标准车）、旅客5万人次。
硬件设施
口岸通道
人工通道
截至2012年7月，皇岗口岸设旅客检查通道50条（出入境各25条）。
自助通道
截至2017年9月，皇岗口岸出境大厅自助查验通道42条。
汽车通道
截至2012年7月，皇岗口岸设出入境小汽车、客车检查通道10条（出入境各5条），货车检查通道40条（出入境各20条）。
验放系统
信息采集
截至2018年1月，皇岗口岸采用信息采集系统，对旅客进行指纹留存和采集工作。
人脸识别
截至2018年6月，皇岗口岸装设人脸识别系统，助力旅客快速通关。
运营情况
运营时间
据2019年6月深圳市人民政府口岸办公室显示，皇岗口岸运营时间如下：
客货运量
2016年，皇岗口岸出入境旅客3053.7万人·次，日均8.34万人·次，同比下降3.4%，出入境车辆870.7万辆·次，日均2.38万辆·次，同比下降1.5%。
2017年，皇岗口岸入境旅客量为3689万人·次。
2019年1月26日至30日，皇岗口岸出入境旅客量近74万人·次，日均14.7万人·次。
交通配套
公交路线
据2019年5月深圳巴士集团官网及香港巴士集团官网显示，皇岗口岸设立皇岗口岸站公交站台。
轨道交通
截至2019年6月，深圳市地铁集团有限公司在皇岗口岸设地铁站，途径该站的轨道交通线路为深圳地铁7号线。
价值意义
皇岗口岸的建成，有效的缓解了文锦渡口岸堵、压车等现象，加强深港、省港之间的交通联系，促进香港与深圳及广东省的经济发展。（《城市规划》 评）
