分类标准
截至2013年，对转基因食品尚无明确分类，根据惯例按不同标准可进行不同分类。
根据转基因食品中是否含有转基因源为标准可分为如下三种不同类型：
（1）食品本身不含转基因的转基因食品，是指食品尽管来源于转基因生物，但其产品本身并不会有任何转移来的基因。
（2）转基因食品中确实含有转基因成分，但在加工过程中其特性已发生了改变，转移来的活性的基因不复存在于转基因食品中的转基因食品。
（3）转基因食品中确实带有活性的基因成分，人们食用这种转基因生物或食品后，转移来的基因和生物本身固有的基因均会被人体消化吸收的转基因食品。
根据转基因食品来源的不同可分为如下三种不同类型：
（1）植物性转基因食品。所谓植物性转基因食品，是指以含有转基因的植物为原料的转基因食品。
（2）动物性转基因食品。所谓动物性转基因食品，是指以含有转基因的动物为原料的转基因食品。
动物的转基因食品，主要是利用胚胎移植技术培养生长速率快、抗病能力强、肉质好的动物或动物制品。
（3）微生物转基因食品。所谓微生物转基因食品，是指以含有转基因的微生物为原料的转基因食品。转基因微生物食品，主要是利用微生物的相互作用，培养一系列对人类有利的新物种。
根据食品中转基因的功能的不同大致可以分成以下6种类型：
（1）增产型的转基因食品
（2）控熟型的转基因食品
（3）保健型的转基因食品
（4）加工型的转基因食品
（5）高营养型的转基因食品
（6）新品种型的转基因食品
代表食物
1、木瓜据悉，市场上卖的95%以上的木瓜都是，这或许出乎很多人的想象。
2、大豆及豆制品（包含大豆油）非转基因大豆：为椭圆形状，有点扁。肚脐为浅褐色。豆大小不一。打出来的豆浆为乳白色转基因大豆：为圆形，滚圆。肚脐为黄色或黄褐色。豆大小差不多。打出来的豆浆有点黄，用此豆制作的豆腐什么的都有点黄色。
3.胡萝卜非转基因胡萝卜：表面凸凹不平，一般不太直，从头部到尾部是从粗到细的。且头部是往外凸出来的。转基因胡萝卜：表面相对较光滑，一般是直的，它的尾部有时比中间还粗。且头部是往内凹的。注：胡萝卜只有在秋冬季节有，夏季的一般是转基因的。
4、土豆非转基因土豆：样子比较难看，一般颜色比较深，表面坑坑洼洼的，同时表皮颜色不规则，削皮之后，其表面很快会颜色变深，皮内为白色。转基因土豆：表面光滑，坑坑洼洼很浅，颜色比较淡。削皮之后，其表面无明显变化。检验方法：先削皮后看变化再决定吃不吃。
5、西红柿、圣女果转基因西红柿：颜色鲜红很好看，果实较硬，不易裂。小西红柿都是转基因的，有红的，有黄的，形状有两种，一种是椭圆形，还有一种是圆的。非转基因西红柿形状比较大，也有些形状比较小的。从味道看，非转基因的有些酸味，转基因的没有酸味，是一种半生不熟的甜味，吃过小西红柿（也叫圣女果）的人都知道这种味道。非转基因西红柿成熟以后，捏起来里面是软的。转基因的捏起来发硬。
非转基因西红柿不耐储存，转基因的放很久都不腐烂。
6、部分水稻及大米在国内取得转基因大米合法种植权的地区是湖北，要警惕细长的很亮的米。容易与东北“长粒香”混淆。
7、小麦与面粉转基因小麦籽粒色白透明发亮，全角质，属硬质强筋优质面包小麦品种，特优转基因9506小麦2008年在安徽面世，面粉中还有漂白剂、滑石粉混在里面，就更难识别。
8、玉米及玉米油2011年国内转基因棉花种植比例高达71.5%，国内批准的国产转基因棉花品种太多，至少数百。转基因玉米：甜脆、饱满、体形优美、头颗粒尾差不多，俗称甜玉米，全部进口玉米基本都为转基因玉米。转基因玉米油：在超市购买玉米有时，一定要仔细看标签，是否标有转基因字样。
9、菜籽及菜籽油转基因菜籽出油率高，目前国家已经确认的是黄籽油菜渝黄1号和2号。非转转基因菜籽是指我国原先有的一些菜籽品种，这种菜籽产是要低些，出油率低些。
10、白菜及辣椒等大白菜福山大包头，这是国家目前已经确认含有转基因的白菜品种。
历史背景
上世纪80年代，转基因乙肝疫苗被研制成功。其原理是，将乙肝病毒基因中负责表达表面抗原的那一段“剪切”下来，转入酵母菌里。被转入乙肝病毒基因的酵母菌生长时，就会生产出乙肝表面抗原。
而酵母菌是一种能快速生长繁殖的生物，于是乙肝表面抗原就被大量生产出来。只后技术接着发展，美国最早对转基因植物进研究。首例转基因生物（Genetically Modified Organism，GMO）于1983年问世，转基因作物（1986）批准进行田间试验，延熟保鲜番茄（1993）（Calgene公司生产）在美国批准上市，开创了转基因植物商业应用的先例。
因此卖给消费者的第一种转基因食物是西红柿。
国际现状
美国是转基因食品最多的国家，60%以上的加工食品含有转基因成分，90%以上的大豆、50%以上的玉米、小麦是转基因的。在我国，转基因食品还比较罕见，到目前为止，经农业部生物工程安全委员会准许商业化的转基因作物仅有6个，其中有3个涉及食品，即两种西红柿、一种甜椒。
但是，随着我国加入WTO的推进和全球一体化的到来，食用转基因食品将成为不可回避的事实。
那么，当越来越多的转基因食品呈现在我们面前时，首当其冲的问题就是：转基因食品敢吃吗？消费者能接受吗？人们食用转基因食品后，有副作用吗？持怀疑态度的理由是：害虫都不敢轻易下口的转基因作物，一旦变成粮食和农副产品，让我们一日三餐皆不离，是不是连同那些抗虫基因也消化了呢？愈来愈耐贮藏的西红柿会引起人体的变异吗？
由此，在英国曾发生由抗虫土豆引起的环保组织狂摔超市中的基因食品、各种媒体纷纷声讨转基因食品的事件。美国、加拿大两国的消费者虽然大多数已接受了转基因食品，但仍有27%的消费者认为食用转基因食品可能会对健康造成危害。
在此情况下，转基因技术（包括转基因食品）的安全性问题，很快引起人们的极大关注，世界上许多国家都制定了对转基因生物的管理法规和办法，负责对其安全性进行评价和监控，其内容主要集中在环境安全性和食用安全性两方面。
我国正在起草的命名为《中国生物安全国家框架》的法规，规定了本着对全人类和子孙后代长远利益负责的态度，从生物安全性问题的广泛性、潜在性、长期性、严重性上做好生物安全管理工作，同时要求对进口的转基因食品进行严格的安全检测，真正确保消费者的利益。
曾参与英国“多利羊”的克隆工作，十几年来一直从事基因工程方面研究的中国农业大学食品学院院长、博士生导师罗云波教授认为，从本质上讲，转基因生物和常规育成的品种是一样的，两者都是在原有的基础上对某些性状进行修饰，或增加新性状，或消除原有不利性状。
虽然，目前的科学水平还不能完全精确地预测一个外源基因在新的遗传背景中产生什么样的相互作用，但从理论上讲，转基因食品是安全的。对长期食用转基因食品是否有副作用的问题，罗教授认为是不会的，一是因为转基因食品上市之前是经过大量试验和许多部门严格检验的；二是转基因食品在体内不积累。总之，转基因食品的前景是乐观的。
至于消费者能不能接受转基因食品，国际消费者联合会主席陈黄穗介绍，为保护消费者，国际消联向联合国食品委员会建议：转基因食品应有标识，让消费者明明白白地知道食品是否含有转基因，由他们自己决定是否选择这类食品。
国内现状
2006年3月20日开始实施的《农业转基因生物标识管理办法》，只要求被列入目录的转基因生物产品必须进行标识。
在一些超市中发现，很少有食品标注“转基因产品”或“以转基因原料制成”等标识。
有些产品倒是在精美的标签上印了“不含胆固醇”等字样。巧克力、蕃茄酱等可能含有转基因成分的食品，也只是在标签中印上了“不含防腐剂”、“不含黄曲霉素”。转基因食品对许多消费者来说是一个新生事物，很多人对此还没有一个科学的认识，对转基因食品的安全性能有一种恐惧感。商家如果贴出转基因标识，可能对自身销量有影响。
相关谣言
人们怀疑食用转基因食物会给身体带来一些不好的后果，比如致癌、不育等等。
这几年，转基因食品安全性问题备受社会关注。作为一项生物新技术，转基因在国内的发展之路可谓曲折坎坷。网络上，关于转基因的口水战此起彼伏，有关转基因食品的各色谣言漫天飞。在这样的舆论环境中，有的企业利用部分消费者对转基因技术的认知欠缺和焦虑心理，为追求自身利益而不顾市场规则，把“非转基因”作为卖点加以炒作。
这种做法违背了广告法等相关法规，其结果不仅导致行业竞争的无序，更加剧公众对于转基因技术的恐慌情绪。转基因与非转基因商战的背后，是企业的利益之争，与转基因食品安全性并无本质关联。但这样一场商战，却付出了惨痛的代价——它打破了行业间公平竞争的市场环境，助长了各类“妖魔化”转基因谣言的传播，给转基因技术的研发应用设下重重障碍。
目前在世界科学界没有研究表明转基因食品对人体有害。事实上，在我国，转基因食品的安全性也是有定论的。2014年6月，国家农业转基因生物安全管理部际联席会议办公室联合中国科协科普部，编印了《理性看待转基因》科普读本，读本中指出“国际组织、发达国家和我国开展了大量的科学研究，均认为上市的转基因食品与传统食品同样安全。”
也就是说，凡是通过转基因安全评价，获得安全证书，进入市场的转基因食品都是安全的。
