仙人模式的形成
對于仙人模式是這樣的，人本身發動忍術是依靠發動體内的查克拉發動，那查克拉是如何形成的呢？是依靠人啊本身的精神能量和身體能量的混合，就出現了查克拉，那在制造查克拉的基礎上混入自然的力量，就出現仙術的能量！忘說了，之前形成查克拉，要讓兩種能量平衡，混入自然之力也要維持一個平衡，就各是三分之一，如果沒有平衡，就會變成蛤蟆，自來也大人非常努力，但依然還是沒有達到絕對的平衡，所以還有點像蛤蟆，如果修煉仙術失敗，就會變成永遠的蛤蟆，最後變成石頭，仙術的能量出現後，發動的忍術就叫仙術，這樣有什麼特點呢？自然之力很龐大，仙術者可以依靠自然力恢複自己流失的能量，而且本來就多出了别人等于三分之一的查克拉，這對于高手是什麼概念？更主要的是發動仙術後本體實力大幅變強，比如一個巨石你舉不起來，但使用仙術就能舉起了.後期鳴人VS佩恩之時,因為無法直接對抗佩恩,因此必須要依靠仙人模式增強力量,但是剛剛修煉完成的鳴人僅僅能維持5分鐘的仙人模式,所以為了能夠打倒佩恩,鳴人采用了他以往修煉的方法,利用影分身來吸收自然能量,自己前往戰場,但是因為吸收自然力量過于困難,最終鳴人隻能放置2個影分身在妙木山吸收能量.而這個舉動也成功讓他阻止佩恩
本篇
再次尋找佐助的蹤影失敗後，回到木葉，卻驚聞自來也被佩恩殺害的噩耗。為此曾一度悲傷的他，因為伊魯卡老師和鹿丸的鼓勵，而再度重新振作起來，并協助解開自來也臨終前留下的暗号；可惜的是仍然沒有頭緒。為了替自來也報仇，他決定接受深作大人的提議，前往自來也曾修行的妙木山，作艱苦的‘仙術’訓練。訓練期間，鳴人險變青蛙，幸得深作大人用術阻止，不過鳴人卻整身是傷。經過一番修行，鳴人總算是基本掌握了自然力量，故深作大人建議轉為不用蛤蟆油的練習，同時也給了鳴人自來也的遺作──‘百練忍傳’。
420話中，鳴人基本已掌握了深作所授的‘蛙蹼手’，及能在不動的狀态下吸收自然力量，控制仙術查克拉。此時深作告誡鳴人有關仙人模式的缺點，就是隻能維持5分鐘左右；而且每一次使用前，需經一段時間、在靜止的狀态下吸取足夠的自然力量方可。因此如果在不動的狀态下，就很容易成為敵人的靶子。為免如此，使用時就必須有其他夥伴同在，以為其争取充裕的時間吸收自然力量。但深作自認為最有效的方法，就是與鳴人融為一體，以求能同時分擔‘動’和‘靜’兩邊的工作。
另一邊廂，木葉隐村正受到佩恩的摧毀，身為五代火影的綱手，目前隻能祈求鳴人這位‘預言之子’的回歸……
421至425話中，深作在和鳴人進行融合訓練時被鳴人體内的九尾妖狐排斥。眼見之前的修煉即将白費，鳴人萬分苦惱。但當他看見自來也在深作背後留下的暗号後，便堅始修煉。鳴人希望透過一邊跑一邊和深作融合，但修煉令深作也傷痕累累。深作指出要同時移動和收集自然能量就如望左的時候同時望右，是不可能的。鳴人頓時有所覺悟……現在與佩恩以在木葉開戰。429話中，鳴人成功練成了‘仙術’訓練，成為最強的仙人。之後，鳴人和深作得知聯絡蛙幸助被幹掉，便知道木葉出事了。在木葉附近的蛤蟆仙人孩子的媽志麻用‘召喚術’把鳴人和深作召喚過來。
430話中，鳴人穿了和自來也相同的外套，載着自來也的書卷，以仙人模式和深作、蛤蟆文太、蛤蟆健和蛤蟆廣在木葉出現，看見被佩恩蹂躏的家鄉，鳴人無語可發。此時剛被複活的‘修羅道’，襲向綱手，被鳴人的‘螺旋丸’秒殺。鳴人對着‘天道’說: “一決勝負吧!!!!”鳴人和‘天道’之戰亦告揭開序幕。仙人鳴人使出壓倒性的力量，施展了新術－可投擲至目标的‘仙法 - 風遁‧螺旋手裡劍’及‘仙法‧螺旋連丸’‘蛙手印’，先後把‘修羅道’、‘人間道’、‘畜生道’‘餓鬼道’、‘地獄道’一招秒殺。‘天道’先使出‘神羅天征’把鳴人及其影分身擊開；及後鳴人欲聯同深作使出幻術，卻被天道的‘萬象天引’所逮，并為‘餓鬼道’強逼鳴人解除仙人模式。幸‘餓鬼道’因吸取過多仙術查克拉，反變成石化蛙。但餘下的‘天道’知仙人深作将要使出幻術，便先使出‘萬象天引’，利用黑棒把被吸來的深作幹掉；再把鳴人拉引過來并摔在地上，用黑棒貫穿其雙手。鳴人質問‘天道’為何要這樣做，而‘天道’也向鳴人透露自己的目的……
437~438話中，雛田為了救援鳴人而被‘天道’重傷，鳴人一怒之下爆發九尾的力量，并露出第六條尾巴，及顯現出九尾的骨骼。天道的絕技‘神羅天征’及‘萬象天引’對鳴人完全無效，不得不逃到村子外，暗中使出了他的隐藏絕技‘地爆天星’。
439話中，面對禁術‘地爆天星’，鳴人爆發出八條尾巴，正當鳴人要露出第九條尾巴時(把封印九尾的符咒撕掉)，四代目火影突然出現，阻止鳴人……
440~443話中，與四代目火影見面之後，鳴人才知道自己是四代目的兒子，情緒激動。四代目相信鳴人一定能夠守護木葉，幫鳴人把封印修複，九尾瞬間消失。鳴人變回了仙人模式後，以自來也所授的螺旋丸壓倒性的秒殺天道，成為最強的仙人。及後鳴人追蹤長門的真身，半路中受到井野父親的阻擋，但還是由鹿丸父親化解了，鳴人終于到達長門真身的所在地。
448~449話中，鳴人與長門一番對話後，長門被其永不放棄的意志所打動，決心将促成和平的願望交付鳴人。長門使用‘外道·輪回天生之術’令木葉所有死亡者複活(不包括自來也)，但相反卻犧牲了自己的性命。小南把長門及彌彥的遺體帶走，同樣把希望托付給鳴人。鳴人決意繼承師父(自來也)及師兄(長門)的遺願……
