体制
军区四大部、军区空军
警备区、省军区
野战军
现陆军第一集团军下辖：
军直部队：
电子对抗旅：江苏无锡
陆军航空兵第5旅：江苏南京
两栖摩托化步兵第3旅（驻浙江金华，代号73051部队）
机械化步兵第178旅
两栖装甲第10旅（驻江苏苏州，代号73041部队）
炮兵第九旅（驻江苏无锡，代号73031部队）
远程火箭炮旅
防空旅（代号73056部，驻江苏镇江）
现陆军第十二集团军下辖：
军直部队：
特种作战第36旅（驻新沂）
空骑兵第179旅（驻南京）
机械化步兵第34旅（驻滁州）
机械化步兵第35旅（驻徐州）
装甲第2旅（驻徐州）
炮兵旅（驻宿迁）
高炮旅（驻淮安）
现陆军第31集团军下辖：
军直部队：
特种作战旅
两栖机械化步兵第86师
摩托化步兵第91师
摩托化步兵第92旅
装甲14旅
炮兵第3旅
防空旅
历史沿革
南京军区成立于1955年，其前身经历了新四军、华东野战军、第三野战军、华东军区等主要发展时期。南京军区部队是一支战功卓着、具有优良作风和光荣传统的部队，无论战争年代还是和平时期，在保卫国防、维护社会稳定和人民生命财产安全中屡建功劳，涌现出大批先进集体和个人，其中“英雄硬六连”、“南京路上好八连”、“鼓浪屿好八连”和“战斗英雄——黄仲虎”、“抗洪钢铁战士——吴良珠”、“清正廉洁一身正气的好干部——范匡夫”等就是突出的代表。在新的形势下，军区党委认真贯彻军委新时期军事战略方针，按照江主席五句话总要求，加强部队全面建设。
特别是近年来，着眼“信息化、智能化、一体化”的军事发展趋势，以科技练兵为龙头，抓好部队军事训练，多次成功地组织了陆海空三军联合作战演习，提高了部队在现代技术特别是高技术条件下的整体作战能力。为了适应部队现代化建设需要，军区党委始终把培养高素质新型军事人才摆在突出位置，通过引进地方大学生、特招地方专业技术人才、派遣军事留学生和依托普通高校招收国防生、培养研究生等多种形式，引进大批优秀人才，不断提高干部队伍的整体素质，有力地推动了军事斗争准备深入发展，部队全面建设朝着现代化的目标不断迈进。
部门设置
中国人民解放军南京军区是中国人民解放军主管江苏、安徽、浙江、江西、福建、上海五省一市军事事务的大军区，总部设于南京。
战备方案
2013年4月中旬，南京军区某通信团在上级连续两次的战备通信演练考核中交出这样一组数据：9种通信手段组网时间缩短一半以上，一组指令经20多个台站传递一字不差，数据流经上百公里传输信号衰减不到0.1%。作训参谋杨林感慨地说，按照工程化标准抓战备，不仅出动速度大为缩短，作战效能也得到了有效提升。
