格式
每篇文章或资料应有一个文献标识码，并且规定了与每种文献标识码相对应的文献中的数据项，即格式。
以下是参考文献类型标示符的书写标准和部分示例。
专着
——[序号]主要责任者．文献题名[M][文献类型标识出版：出版者，出版年.起止页码.
专着（个人着作）——[序号]主要责任者。文献题名[M]．版次（第一版略）、出版地：出版者，出版年.起页－止页。
专着（集体着作）——[序号]章节责任者．题名．[M]．见（In）：主编．书名．出版地：出版者，出版年.起页－止页。
示例：柯斯文．原始文化史纲[M]．北京：人民出版社，1955．28－38．
期刊文章
——[序号]主要责任者．文献题名[J]刊名，年卷，（期）：起页－止页．作者姓名．（姓在前，名在后，名可用缩写（西文））．作者在3名以下全部列出，3名以上列出前3名，后加等（中文）、他（日文）、etal（西文）．[]内为文献标识码。
示例：张斌．谈谈句子的信息量[J]．湖南广播电视大学学报，2000，9⑶：1－3．
报纸文章
——[序号]主要责任者．文献题名[N）．报纸名，出版日期（版次），
示例：朱华．关于《华岳全集》的一点看法[N]．光明日报，1962－03－06⑻．
专利文献
——[序号]专利所有者．专利题名[P]．专利国别：专利号，出版日期.
示例：姜锡洲．一种温热外敷药制备方案[P]．中国专利：881056073，1989－07－26．
论文集中的析出文献
——[序号]析出文献主要责任者．析出文献题名[A]．原文献主要责任者．原文献题名[C]．出版地：出版者，出版年．析出文献起页－止页.
示例：别林斯基．论俄国中篇小说如果戈里君的中篇小说[A]．伍蠡甫．西方论文选：下卷[C]．上海；上海译文出版社，1979．377－380.
学位论文
——[序号]主要责任者．文献题名[D]．出版地：出版者，出版年.
国家（技术）标准
——[序号]GB7714－37，文后参考文献着录规则、标准编号和标准名称[S].
论文集
——[序号]主要责任者．文献题名[C]出版地：出版者，出版年，文献起页－止页.
科技报告
——[序号]……[R]
各种未定义类型的文献
——[序号]主要责任者．文献题名[Z]．出版地：出版者，出版年.
示例：黄华．论思维[Z]．北京：北京大学出版社，1999.
类型标识
根据GB3469规定，以单字母方式标识以下各种参考文献类型：
⒕3.2对于专着、论文集中的析出文献，其文献类型标识建议采用单字母“A”；对于其他未说明的文献类型，建议采用单字母“Z”。
⒕3.3对于数据库（database）、计算机程序（computerprogram）及电子公告（electronicbulletinboard）等电子文献类型的参考文献，建议以下列双字母作为标识：
电子文献的载体类型及其标识
对于非纸张型载体的电子文献，当被引用为参考文献时需在参考文献类型标识中同时标明其载体类型。本规范建议采用双字母表示电子文献载体类型：磁带（magnetictape）——MT，磁盘（disk）——DK，光盘（CD-ROM）——CD，联机网络（online）——OL，并以下列格式表示包括了文献载体类型的参考文献类型标识：
[文献类型标识/载体类型标识]
如：[DB/OL]——联机网上数据库（databaseonline)
[DB/MT]——磁带数据库（databaseonmagnetictape)
[M/CD]——光盘图书（monographonCD-ROM)
[CP/DK]——磁盘软件（computerprogramondisk)
[J/OL]——网上期刊（serialonline)
[EB/OL]——网上电子公告（electronicbulletinboardonline)
以纸张为载体的传统文献在引作参考文献时不必注明其载体类型。
主要问题
A类文献是期刊质量的一个标志。医学期刊中论着是期刊的核心部分，学术价值较高，一般都被定为A类文献；综述性文章一般篇幅较长，以汇集文献资料为主，或着重评述，具有权威性，对学科的进一步发展有引导作用定为A类。论着摘要、病例报告、经验交流等类文章，文章标志码的统一存在一定困难，有的定为B，有的定为其它，须根据文章的具体情况分别对待。述评、专题讨论等一般标志定为C；简短的病历报告、短篇报道一般定为D。
文献标识码一般不需要作者标注，而是由期刊专职人员根据文章内容划分的。因医学期刊有时很难绝对区分各类文献的差异，所以不同时期期刊同样文章格式的标志码有所不同，这与编辑人员对上述规范的理解程度不同有一定的关系；同一种期刊同类文章的标志码也有不同，这与文章的篇幅及论述的详尽程度有关。如同一期的《临床内科杂志》中，病例报告有的标注为B，有的标注为D。总之，目前文献标识码还存在一定的问题，还有待进一步的规范和统一。
