抑制劑
蛋白酶K是一種絲氨酸蛋白酶，因此可以用苯甲基磺酰氟抑制其作用，苯甲基磺酰氟是一種絲氨酸蛋白酶的抑制劑。在純化蛋白質時用于防止蛋白質的降解。
作用
值得注意的是，蛋白酶K在 原位雜交技術中通常用于雜交前的處理,它具有消化包圍靶DNA蛋白質的作用,以增加探針與靶核酸結合的機會,提高雜交信号.但蛋白酶K的濃度過高、消化時間過長或孵育溫度過高時,都會對細胞的結構有一定的破壞,導緻組織切片的脫落,細胞核的消失,從而影響雜交結果.EDTA緩沖液可以替代蛋白酶K的作用,解決上述出現的問題,并能達到理想的染色效果.
保存方法
保存：保存在－20℃冰箱裡，避免反複凍融，有效保證12月。
孵育溫度為55至65℃，理想孵育溫度為58℃，孵育時間為15分鐘至48小時；理想孵育時間為2小時。
應用
蛋白酶K已廣泛應用在 皮革、 毛皮、 絲綢、 醫藥、 食品、 釀造等方面。皮革工業的 脫毛和 軟化已大量利用蛋白酶，既節省時間，又改善勞動衛生條件。蛋白酶還可用于 蠶絲脫膠、肉類嫩化、酒類澄清。臨床上可作藥用，如用胃蛋白酶治療消化不良，用酸性蛋白酶治療支氣管炎，用彈性蛋白酶治療脈管炎以及用胰蛋白酶、 胰凝乳蛋白酶對外科化膿性創口的淨化及胸腔間漿膜粘連的治療。加酶洗衣粉是 洗滌劑中的新産品，含堿性蛋白酶，能去除衣物上的 血漬和蛋白污物，但使用時注意不要接觸皮膚，以免損傷皮膚表面的蛋白質，引起皮疹、濕疹等過敏現象。
