建制沿革
明·嘉靖二十六年（1547年）六月，蒙古武力东移，哈布图哈萨尔的十六世孙布巴什惕那颜驻牧嫩江下游两岸，号所部为“郭尔罗斯”。
清·顺治五年（(1648年）十二月二日，郭尔罗斯部酋长布木巴被册封为镇国公爵，掌郭尔罗斯后旗扎萨克，此为旗治之始。
光绪三十二年（1906年）设肇州厅，治所设在今肇源城。实行蒙汉分治。民国初，省以下设置沿袭清制，分为道、府、厅、州、县。
民国二年（1913年）奉大总统令废府、厅、州，存道、县由厅改县后隶属龙江道，肇州县城设今肇源城，名称肇州，3月20日执行。7月肇东分防厅晋升为县，旗境东部为肇东县，西部为肇州县，蒙汉三个政权并存，继续实行蒙汉分治。伪满洲国属黑龙江省。
1932年伪县公署因洪水迁到薄荷窝堡。
1934年又因洪水迁到“老城基”（今肇州址）。
1934年12月1日结束蒙汉分治。
1935年郭尔罗斯后旗公署由四站老爷屯迁至肇源城，实行旗制。仍用郭尔罗斯后旗名称，隶属滨江省。
1945年12月20日，民主政府成立。郭尔罗斯后旗隶属嫩江省，省会在齐齐哈尔。隶属哈西专员公署。
1947年2月7日，黑龙江省和嫩江省合并，称黑嫩省，本旗属第四专区，专署驻肇州县。是年9月17日，撤销黑嫩省，恢复黑龙江省和嫩江省建制，本旗仍属嫩江省。
1949年5月5日，嫩江省与黑龙江省合并为黑龙江省，本旗隶属之。
1954年8月1日，黑龙江省与松花江省合并为黑龙江省，原署各县旗皆属之。
1956年4月11日，经国务院批准，郭尔罗斯后旗政府奉令改称肇源县。此为“肇源县”之始。
1958年8月27日，肇源县隶属松花江专署。
1965年6月14日，松花江专署改为绥化专署，肇源县随属。
1992年划大庆市管辖。
行政区划
肇源县有47万人口，21个民族，辖16个乡镇，6个农林牧渔场，135个行政村。
肇源县辖8个镇、8个乡。福兴乡、三站镇、薄荷台乡、二站镇、和平乡、肇源镇、头台镇、大兴乡、浩德蒙古族乡、义顺蒙古族乡、古龙镇、新站镇、民意乡、茂兴镇、超等蒙古族乡、古恰镇。以及立陡山良种场、新立良种场、经作场、种畜场、茂兴湖水产养殖场。
福兴乡辖7个村委会（永兴村、福兴村、新兴村、瑞兴村、复兴村、吉兴村、义兴村）。
三站镇辖11个村委会（宏大村、宏源村、宏旗村、宏林村、宏伟村、宏生村、宏合村、宏昌村、宏亮村、宏权村、宏光村）。
薄荷台乡辖个村委会（八家子村、前台村、后台村、双龙村、芳春村、永祥村、哈拉海村、葫芦系村、永久村）。
二站镇辖12个村委会（东海峰村、裕民村、利民村、希望村、土城子村、小湾子村、莲花泡村、新发村、小城子村、曙光村、平原村、丰产村）。
和平乡辖5个村委会（和平村、立功村、华原村、工农村、敏字村）。
肇源镇辖11个社区、10个村委会（东山社区、城北社区、南苑社区、城南社区、兴源社区、松花江社区、东苑社区、东城社区、广场社区、西海社区、龙源社区、兴安村、老虎背村、双胜村、四方山村、郊原村、东兴村、代龙村、龙谊村、临江村、解放村）。
头台镇辖10个村委会（头台村、团结村、七家子村、瓦房村、三合村、东大村、花尔村、劳动村、仁和卜村、革新村）。
大兴乡辖6个村委会（前进村、通兴村、联结村、支前村、同心村、前土村）。
浩德乡辖5个村委会（老山村、西浩德村、兴海村、石庄子村、莲花村）。
义顺乡辖7个村委会（东义顺村、西义顺村、长发村、勇进村、长胜村、东发村、革志村）。
古龙镇辖14个村委会（永胜村、得胜村、河南村、古龙村、道宝村、立陡山村、长山村、东太村、大革村、永跃村、立强村、伍家村、富强村、共荣村）。
新站镇辖2个居委会、11个村委会（新站居委会、新肇居委会、安合村、靠山村、先进村、振余村、新站村、新合村、发展村、向前村、古城村、巴彦村、新城村）。
民意乡辖6个村委会（自主村、大庙村、公营子村、建国村、民意村、建民村）。
茂兴镇辖7个村委会（当权村、自力村、一心村、合心村、幸福村、光明村、辉煌村）。
超等乡辖7个村委会（成功村、维新村、自由村、有利村、共和村、博尔诺村、超等村）。
古恰镇辖10个村委会（古恰村、哈友村、兴发村、托古村、沿海村、仓粮村、孟克里村、三家子村、新立村、前永利村）。
新立良种场辖3个村委会（六家子村、小河子村、新立屯）。
自然资源
肇源县自然条件得天独厚，资源极其丰富，“水、草、田”三分天下，有耕地180万亩、草原173万亩、水面103万亩。野生动植物繁多，有狐、貉、鹿等野生动物达200多种，草本植物1800多种，有蒲公英、地丁、车前子、防风、玉竹等野生药材百余种。肇源县可养鱼水面已发展到59.5万亩，水产品总量实现2.62万吨，名优鱼养殖面积达到27万亩，河蟹养殖面积5000亩。水产品久负盛名，历史上曾是清王室鳇鱼贡品的重要产地，鱼类品种达6目11科39种。地下蕴藏着大量石油、天然气等矿产资源，已探明油气总储量达7亿吨。地上有盐碱和建筑工程砂、黄粘土、火硝等，火硝产量、质量闻名全省，建筑砂石储量丰富。地下水资源十分丰沛，总量达51.4亿吨。
经济建设
总述
2012年，肇源县地区生产总值实现140亿元，增长14.5%。 全口径财政收入和公共财政收入实现13.2亿元和6.2亿元，分别增长39%和73%。社会消费品零售总额实现15.8亿元，增长15.9%。油与非油经济比重达到75:25。城镇居民可支配收入和农民人均纯收入实现16584元和 10962元，分别增长18.5%和17.3%。
第一产业
肇源县被誉为松嫩平原腹地集粮牧渔油于一体的“塞北江南”、“鱼米之乡”，是全国商品粮基地县、全省产粮大县、全省牧业大县、全省渔业大县和全省绿色食品基地县。
2013年肇源县现代农业示范区核心区面积发展到20万亩，争取农业项目62个，到位资金3.55亿元，粮食总产实现25.4亿斤，再度荣获全国粮食生产先进县。2014年，实现全年新增水田10万亩、有效节水灌溉农田7万亩。推进畜牧业“三退三进”由奶牛向各类畜禽复盖，新建标准化养殖小区（场）17个，实现产值40亿元；水产业重点推进兴安高效渔业养殖示范区、南引流域水产养殖开发区建设，打造43.5万亩名特优渔业养殖基地，水产品总量达到2.7万吨。棚室生产重点推进和平塞北花都、福兴乡复兴村、大兴乡联结村、民意乡建民村4处示范区建设，加大果蔬冷链物流基地建设力度，力争促成“北菜南运”项目。
肇源县“水、草、田”三分天下，截止2013年有耕地180万亩、草原173万亩、水面103万亩。肇源县可养鱼水面已发展到59.5万亩，水产品总量实现2.62万吨，名优鱼养殖面积达到27万亩，河蟹养殖面积5000亩。水产品久负盛名，历史上曾是清王室鳇鱼贡品的重要产地，鱼类品种达6目11科39种。
第二产业
肇源县2013年有工业企业78家。培育壮大了畜禽、绿色食品、服装加工和石油石化四个工业企业群，构筑并形成了以食品工业为骨干、油化工业为支撑、轻工和制造业为补充的工业经济格局。规划建设了松花江工业园区、新站民营经济区、港桥经济区三个工业园区。加快推进了大庆肇源皮革城和帅亿生态示范城建设。
2013年引进千万元以上的大项目16个，累计到位资金20多亿元。俄罗斯罗姆斯制衣、帅亿集团、江西鸭鸭、吉林糖业、松拖制造、桥源化工、草原兴发、完达山乳业、北大荒米业等实力企业和大庆皮革城建设项目相继落户肇源。2003年，全县全口径工业产值完成154301万元，同比增长23.4%；增加值42121万元，同比增长31.1%；利税8841万元，同比增长16.9%。
第三产业
肇源县2013年第三产业增加值实现27亿元，增长9.8%。成功举办第八届莲花节。莲花湖国家湿地公园通过国家湿地中心评审。衍福寺、西海公园等景区景点加快建设。全年实现旅游收入1.7亿元。沈铁内陆港运力提升到日开行3列，年货运能力提升到380万吨。餐饮业实现营业收入1.6亿元。新增“万村千乡”农家店20个。进出口总额实现1924万美元。完成全省银联卡受理示范县创建工作，金融机构发展到8家，银行存贷款余额分别达到59.6亿元和26.5亿元。
同时开拓俄罗斯市场，发展对外贸易，“肇源制造”产品，蕃茄酱、葵花仁、草原兴发肉食品、古龙贡米和北大荒精制米远销欧盟、中东、俄罗斯及东欧和东南亚等三十多个国家和地区，对俄及东欧出口贸易发展前景广阔。
社会事业
文化事业
2013年新建社区综合文化站2个、村级文化活动室20个。鼓励民间资本参与公共文化服务体系建设，促进文化产业多元发展。争取白金宝博物馆立项。小拉哈遗址晋升为国家级文物保护单位，民意乡大庙村被列入第一批省级历史文化名村，县龙江剧艺术中心荣获第五届全国“服务农民、服务基层”文化建设先进集体，并作为基层专业院团唯一代表向全国同行介绍经验。
教育事业
2013年，县一中新建项目启动建设，新（改）建农村中小学校7所、城乡幼儿园13所。
医疗卫生
肇源县2013年完成2个乡镇卫生院升级改造和41个村卫生所标准化建设，组建社区卫生服务站11个。县中两院晋升为二级甲等医院，茂兴卫生院通过甲级乡镇卫生院评审，为6个乡镇中心卫生院配备了救护车。医疗保险实现网上即时结算。新建乡镇卫生院2所、村级卫生所41个。设立社区卫生服务中心2处、社区卫生服务站11个。建设村级卫生所76个。打造农村30分钟医疗急救圈和城区步行15分钟医疗保障圈。
社会保障
社会保障体系，累计发放社保、低保资金1.02亿元。肇源县纳入低保对象16114人，医疗保险参保面扩大，参保职工总数达到15837人。2003年，4956名下岗失业人员实现就业和再就业。已开展保险业务37种，年承保金额11亿元，赔付率达55.42%。
基础设施
肇源县内新建城区休闲广场5个、塑胶健身场地4000平方米，改造街角绿地7处，拆墙透绿8处，新建停车场17处。“智慧城市”创建扎实推进，组建城管委，设立乡管办，启动城区保洁权内部承包试点，强力推进城乡环境综合整治，拆除城区违章建筑25处，打造样板村22个，被评为全省文明村镇建设先进县。全县程控电话装机5.61万门，移动用户已达4.9万户。城乡电话普及率达到每百人12.36部。
交通
大庆肇源新港已经建成通航，由大庆肇源新港经佳木斯、同江，一直到俄罗斯的庙街，驶入达旦海峡，直到日本海，“江海联运”成为现实。以大庆肇源新港、松花江公路大桥、嫩江公路大桥为主的“一港、两桥”三纵五横、村村通的道路交通格局构成完善的交通网络。良好的交通区位优势，使肇源成为黑龙江西部大通道上的经贸重镇，参与更广泛的经济大循环。
名优特产
古龙贡米
2001年9月及12月分别获得上海博览会和深圳第四届国际博览会金奖。
立陡山绿色水稻
立陡山绿色水稻产自于黑龙江省肇源县立陡山良种场。
立陡山位于松嫩平原的立陡山下，属国家级水稻开发小区。肥沃的黑土地，清澈的嫩江水，清新的空气，较长的活动积温为立陡山绿色水稻提供了无语伦比的生长环境。勤劳朴实的立陡山人以其世代延续的耕作经验，融合现代农业技术，选择优良品种生产出天然绿色的乡村水稻。经专家确认，立陡山绿色水稻含有多种人体必须的微量元素。
立陡山良种场与黑龙江省第二水稻研究所合作，作为全省水稻良种繁育基地。
旅游名胜
肇源县的旅游资源非常丰富。在境内绵延250公里的松嫩两江左岸，既有悠久瑰丽的古代文化遗产，又有俊秀壮美的自然景观，至今已发掘出古文化遗址105处，发现自然景观20多处，这些自然景观和人文景观沿“黄金水道”分布，从东至西遥相辉映，构画出了龙江西部风格独特的旅游景观。按其地理位置可划分为三个景区。
东部景区以二站莲花湖为中心，主要由莲花湖、双榆寺、玉皇辇、敖木台战迹、望海屯古城等景点构成的莲花湖景区。
莲花湖原名莲花泡。位于肇源县城以东20公里的二站镇莲花泡村以南。她是更新世纪第四纪松花江改道后留下的一个新月湖，总占地面积1800多亩，水域面积150亩，花区面积105亩。莲花湖，不仅花美、水美、风光美，而且还流传着许多美好的传说。
过了莲花湖东行就是望海屯古城遗址（古称宁江州）。相传这是金兀术妹妹的城池，在这里曾与岳飞有过交战。望海屯遗址已被定为省级文物重点保护区。
在莲花湖以西，就是敖木台战迹地。据肇源史志记载，1940年9月，我抗日联军十二支队奉命攻打肇源县城，十二支队三十四大队临时在敖木台屯隐蔽一天，晚间再向肇源县城靠近。不料早饭后，一队日军突然闯进屯内，与三十四大队相遇，双方展开了激战。上午，双方相持不下。下午敌人从公路运来包括炮兵在内的大量援军，由于敌我力量过于悬殊，我们的武器装备和敌人比相差太远。三十四大队的伤亡很大，关大队长、吴教导员都相继牺牲，队伍由闻讯赶来的支队政委韩玉书指挥撤退。不幸的是韩玉书政委在指挥撤退时中弹牺牲。敖木台战斗中共有44位抗联官兵殉难。敖木台战迹地设有古碑、碑文，是进行革命传统教育的基地。
在二站镇与和平乡之间，后欧力马屯东，有一株浓荫蔽天的千年古榆。榆树树围7米多，多人才能环抱。树高近二十米，枝叶繁茂翠绿，遮天蔽日浓荫盖地达百余平方米。树干老态龙钟，从侧面看五根枝干斜插碧空，宛如佛掌。掌心向天，五指垂荫，恰似伞盖，因此当地村民称其为“玉皇辇”，古树根部裸露如游龙四出，不少善男信女叩拜祈祷，奉为“神树”。
中部景区也称九龙旅游区，主要由西海湿地生态旅游区、小城风光、松花江、肇源码头、鸡心滩、黑山、苗家亮子等自然景点构成。此区以松花江上风光为主，以鳇鱼圈为中心，从听鱼、看鱼、说鱼、吃鱼，展现松花江、嫩江交汇之地肇源县独特的鱼文化。
鸡心滩位于肇源镇南部，松花江左侧，与黑山相依，沿水道距肇源港3.2公里，沙滩长2600米，最宽处320米，面积65公顷，因形似鸡心而得名金色的沙滩，碧绿的江水，天然的浴场构成纯朴、秀丽的大自然中心。黑山，依据自身的地形地势景色怡人，草木丛生，是天然的狩猎场所和洗浴场所。每至盛夏，吸引大批游客前来洗浴观光，四季均有好猎者前来狩猎。
西海湿地生态旅游区是九龙旅游区的核心景点，是我县2002年新开发的景点。这里蒲草茂密、芦苇荡漾、莲花盛开、百鸟翱翔、鱼群泛波、稻谷飘香、水天一色、无限风光，是旅游观光的好去处。
西海湿地旅游区位于肇源县城西1公里处。占地面积5500亩，平均水深1.5米，湿地内有天然的芦苇、蒲棒草等水草植物。芦苇荡中，栖息着江鸥、野鸭、大雁等水禽数十种。为了更好地保护和利用湿地资源，县委、县政府制定了五年保护性开发计划。2002年，起动了一期开发工程，修筑了6.45公里的环海路，修建了观鸥台、观鱼观、赏莲池、垂钓池、水上游乐区等设施。购置了电动车、电动船、双人和多人脚踏船、摇控船模、单筒高倍望远镜和广角双筒望远镜等游乐设备。今冬明春将起动二期工程。整个景区按计划完工后，将达到国家3A级标准。
西部景区主要由衍福寺、白金宝、三岔河、大青山出河店战役遗址、他什海古城、龙虎山等景点构成。
衍福寺建于清朝康熙二十三年（1684）年，是郭尔罗斯后旗最高等级寺庙。建寺之后这里的佛事活动非常兴盛，可惜寺庙于1948年12月25日毁于火灾，只留下衍福寺双塔和照壁。这双塔生动逼真、集汉、满、蒙民族风格于一体，距今已有三百多年的历史。它和西藏的佛塔、呼和浩特延寿寺的汉白玉石塔、北京北海公园的白塔、承德外八庙的珐琅塔风格相同。双塔具有较高的艺术价值，以象征圣洁的垩台为基调显得典雅、端庄、秀丽。关于双塔的来历，还有一个神奇的传说。
大庙村后二级台地，即是著名的白金宝文化遗址，其与半山文化遗址齐名。白金宝文化据首次科学考证有三千多年的历史，是“黑水先民”文化的重要组成部分。1974年8月，省博物院首次发掘，发现房屋、窑穴和窑地等遗迹，出土遗物近万件。白金宝遗址是松嫩平原上第一次正式科学发掘的有代表性的青铜器时期的文化遗址，其中敖包遗址内还藏有辽金时期文物，如蒙古族的图腾雄鹰和十三太保李存孝牌位等。白金宝文化遗址现已是国家级古代文化保护区。
三岔河，古称“大口”，俗称“阴阳界”，以栗末水（第二代松花江）和黑水（嫩江）交汇而成。三岔河又是古盛京（今沈阳）至爱珲之间古驿道的必经之地，自古以来许多文人骚客在此留下了优美的诗篇。清康熙二十一年四月，康熙帝到此畅游，留下了“源分长白波流迅，支合乌江水势雄”的诗句。
