曆史沿革
1950年冬，平原省衛生學校創建，由菏澤專員公署衛生科主辦。
1953年，平原省撤消，菏澤地區劃歸山東省管轄，學校名稱改為山東省菏澤初級衛生學校。
1955年下半年，學校由初級衛生學校升為中級衛生學校，學校名稱改為山東省菏澤衛生學校。當年12月正式招收初中畢業生，學制三年。
1958年，經山東省人民政府批準，将菏澤衛生學校升格為專科學校，改建為“山東省菏澤地區醫學專科學校”，學制五年，醫療專業招收初中起點畢業生，同時也招收中專學生。
1962年，停辦大專，改辦中專。
1969年，受文化大革命的影響，學校被撤消。
1970年，學校恢複招生，并由中專升格為專科學校，命名為菏澤地區醫學專科學校，招收二年制工農兵學員。
1973年，改辦中專，學校名稱為菏澤地區衛生學校。
1978年1月，經國務院批準，菏澤地區衛生學校恢複為專科學校，改名為菏澤醫學專科學校。
2009年12月，順利通過山東省高職高專院校人才培養工作水平評估。
2015年1月，學校被授予2014年度“省級文明單位”稱号。
辦學條件
院系專業
截至2016年3月，菏澤醫學專科學校共建有臨床醫學系、護理系、藥學與生物制藥工程系、醫學技術系、醫學檢驗系、醫保營銷系、衛生管理系等8個系以及基礎醫學部、思想政治理論教學部、公共教學部，開設高職專科專業12個。
師資力量
截至2016年3月，菏澤醫學專科學校共有專任教師564人，其中教授、副教授167人，碩士研究生及其以上學曆251人；山東省教學名師、省級優秀教師12人；擁有省級教學團隊3個。省級教學團隊：臨床醫學專業教學團隊（王克志，2011年獲批）、藥學專業教學團隊（尹祥敏，2010年獲批）、護理學專業教學團隊
教學建設
截至2015年12月，菏澤醫學專科學校共有中央财政支持重點建設專業2個，省級特色專業3門；擁有省級精品課程29門；校級實訓基地14個。
2014年，該校教師魏偉獲第四屆醫學（醫藥）院校全國青年教師教學基本功比賽三等獎，劉春霞榮獲山東省青年教師授課比賽一等獎，劉慧霞等6名教師獲山東省微課比賽二、三等獎。
中央财政支持重點建設專業：護理、臨床醫學
省級特色專業：護理、臨床醫學、助産
省級精品課程：藥理學、生理學、診斷學、内科學、内科護理學、外科護理學、診斷學、生物化學、無機化學、有機化學、天然藥物化學、藥劑學、檢驗儀器分析、臨床檢驗基礎、微生物學檢驗、免疫學檢驗、生物化學檢驗、臨床麻醉學、麻醉解剖學、麻醉生理學、麻醉藥理學、麻醉設備學、外科學、婦産科學、兒科學、預防醫學、基礎護理學、護理心理學
校級實訓基地：公共基礎實驗教學中心、機能學實驗教學中心、醫學形态學實訓教學中心、臨床技能實訓中心、護理技能實訓中心、康複治療技術實訓中心、藥學實訓中心、中心實驗室、分析實訓教學中心、口腔技能實訓中心、醫學檢驗實訓中心、中醫學實訓中心、計算機實訓中心、語言實驗室
合作交流
截至2015年7月，菏澤醫學專科學校共先後與山東大學醫學院、青島大學醫學院聯合舉辦在職研究生進修班，開辟了與東南亞國家高校的學術交流，從新加坡、菲律賓等國家引進外籍教師從事英語教學，每年選拔成績優秀、表現突出的學生赴英國深造。
學術研究
科研成果
2015年，菏澤醫學專科學校共批立項各級各類縱向課題47項，其中，劉豔豔副教授申請的項目獲得山東省自然科學基金項目資助；該校專任教師發表國家級和省級論文112篇，申請國家專利4項，科技成果鑒定達到中國國内領先水平3項，省級科技成果獎7項，市級科技成果獎9項；橫向技術服務到款額10.81萬元，縱向科研經費到款額10.60萬元。
2014年，菏澤醫學專科學校共開展聯合科技攻關和技術服務項目共19項；橫向技術服務到款額9.1萬元，縱向科研經費到款額12.5萬元。
學術資源
館藏資源
截至2014年12月，菏澤醫學專科學校圖書館共有館藏紙質圖書67.33萬冊，電子圖書5572GB，紙質期刊2638種，電子期刊3500種，并建立了中國期刊（醫藥衛生）學術文獻二級檢索站。
學術期刊
菏澤醫學專科學校
《菏澤醫學專科學校學報》是由山東省教育廳主管，菏澤醫學專科學校主辦的綜合性醫學學術期刊，原名《菏澤醫專學報》，1989年月創刊，1989年出版兩期。1990年改為季刊，1999年經國家科委核準公開發行，2002年更名為《菏澤醫學專科學校學報》；該刊主要刊登反映該校及所屬院、所的科研、醫療、教學的新成果、新技術，設有基礎醫學、臨床醫學、祖國醫學、護理醫學、預防醫學、麻醉醫學方面的論著、專題報道、臨床經驗、病例報告、技術方法、文獻綜述、專題講座以及教學研究等欄目；該刊先後被确定為中國期刊網收錄期刊、中國科技論文統計源期刊、中國期刊方陣雙效期刊，并入選中國科技期刊文摘數據庫、《中國科學引文數據庫》等多家數據庫，還多次獲得國家和省部級優秀科技期刊獎及科技期刊優秀編輯質量獎。n
文化傳統
學校标識
校徽
菏澤醫學專科學校校徽為環形繞排圖案組合。外圍是文字組合，上部為舒同題校名中文全稱，下部為校名英文全稱。校徽内部圓形部分是圖案和數字組合，上部是具有醫學标志的蛇杖，體現學校的醫學屬性；中間是阿拉伯數字“1950”，說明學校自1950年開始的辦學曆史；底部是盛開的牡丹花，表明學校植根于牡丹之都——菏澤的地域特色。校徽的标準色為綠色，象征着生命、健康和活力。校徽寓意為學校弘揚醫學科學精神，繼承優良辦學傳統，傳承服務人民的辦學宗旨，做生命與健康的衛士。
校訓
懸壺濟世，孜孜以求n
社團活動
截至2015年12月，菏澤醫學專科學校共有各類學生社團31個，涵蓋學術、文藝、體育、科技創新類社團，參與學生3200餘人，2014至2015年度，學術性社團開展業餘專業培訓活動31次，舉行專業知識競賽18次，參與學生1612餘人次；共有社會志願服務隊61個，2014至2015年度，開展校内和校外志願服務691次。
現任領導
學校榮譽
截至2021年，菏澤醫學專科學校為全國健康養老服務生産性實訓基地、全國高等職業教育創新發展行動計劃單位、山東省優質高等職業院校建設單位，先後榮獲“山東省高等學校教學管理先進單位”“全省衛生科技教育工作先進集體”“省級文明單位”“平安校園”“省級園林式單位”“省級衛生先進單位”“省級社會治安綜合治理先進單位”“山東省大學生暑期社會實踐活動先進單位”“山東省青年志願服務先進集體”菏澤市思想政治工作先進單位、菏澤市花園式單位、山東教育慈善獎先進單位等稱号。
2020年12月25日，被國家衛生健康委等授予“無償獻血促進獎”。
