機理
自然界的水不是以單一水分子（H2O）的形式存在的，而是由若幹水分子通過氫鍵作用而聚和在一起，形成水分子簇，國内俗稱‘水分子團’。水分子團小，則容易被人體細胞吸收，水的生理功能強，這種水因而也被稱為活性水”。
宣傳
“小分子水”的宣傳者稱，利用磁場的切割等方式将水磁化，改變水分子的取向，切斷部分氫鍵，就能夠得到團簇小的小分子水。
對水進行磁化的研究在近年來不算少見，水經過靜止磁場或者變化磁場的處理，其理化性質的确會發生改變，而且能在數小時内保持這種性質。然而相關的研究[1,2]表明，磁化處理水的結果是水中的氫鍵含量有少量的上升，會造成水的團簇變大。與“磁化得到小分子水”的說法真好相反，神馬“磁場切割”，估計是對磁力線拍拍腦袋的想法。
小分子水能治病嗎？
宣傳者往往用一些看似很專業的詞彙來吹噓小分子水對疾病的神奇療效，不過，對此果殼網謠言粉碎工深表懷疑（你想，熱水就是小分子水嘛！加熱可以破壞水的部分氫鍵，使水分子團簇變小），接下來就由謠言粉碎工幫您分析幾條常見的“效果”。
1、“飲用後改善人體生物化學作用，升高血中的高密度脂蛋白，成為血管清道夫”。
血漿高密度脂蛋白的确是一種與患心血管病的風險相關的蛋白，被譽為“血管清道夫”，目前醫學界正在緻力于從它入手解決心血管疾病的問題。目前提高其濃度的方法主要是抑制降解酶，僅通過飲水不太可能達到這樣的效果。
2、“飲用後人體内酶的活性増強，血脂易分解，從而降血脂效果好”。
血脂的代謝是個涉及許多酶的複雜過程，降血脂的過程需要部分酶處于激活狀态，部分酶被抑制。籠統地說“使人體内酶的活性增強”，謠言粉碎工不得不評價一句，這實在是很“民科”，提出這個說法的人似乎根本完全不懂血脂代謝的生理過程嘛。
3、“本品處理水中畗含小分子團和水的離子，水很‘分散’，滲透力與溶解力強，易進入細胞内滋養細胞，在血中容易使聚集成團的紅細胞分散開，并使新生旳紅細胞剛度小，變形性大，從而血液流變學指标改善，降低血液黏稠度”。
水的離子是氫離子和氫氧根離子，它們的濃度與pH和溫度有關，而且相當的低（除非變成強酸強堿，那樣更不能飲用了）。細胞内的水含量最重要的是平衡，通過細胞内外的滲透壓控制水分的吸收，維持細胞内的離子在合适的濃度。細胞内的水并不是越多越好，更多的水進入細胞也不存在“滋養”一說；至于血液粘稠度，其原因是多方面（如膽固醇過高，生成血栓等），紅細胞在受到損傷（如酗酒）後其粘結力才會增強而導緻血液粘稠，但在通常情況下都不是主要原因，所以分散紅細胞對降低血液粘稠度一般沒多大作用。
結論：謠言破解。無論是那些裝置能否産生小分子水，還是所謂的小分子水能否治療心血管疾病，都沒有可靠的科學依據，現有的科學知識也不支持這些所謂的功效。這類的産品往往喜歡披上科學的外衣，用看似專業的詞彙來忽悠不明真相的群衆。認真分析起來，這些所謂的科學說辭都是站不住腳的。
學術界
小分子團水，大多依附堿性水制水機存在，商家宣稱這樣形态的水更易被吸收。專家表示，有些水比如礦泉水的分子團确實較小，但十九世紀也沒有任何證據可以證明它與健康有直接關系，更不用說治病了。
為了證明“弱堿性水、小分子團水有益健康”，有商家稱，“世界衛生組織提出的優質健康飲水标準指出，優質健康水應pH值呈弱堿性；小分子團，滲透力強，溶解性好。
通用的《世界衛生組織飲用水标準》第三版共有五大項檢測指标。其中唯一提到pH值的是第五大項第二章“無機部分”第10條，其标準與我國現行标準一樣，為6.5—8.5，原文表述為：低pH值的水具有一定腐蝕性，而高pH值的水會有滑膩感和異味。《世界衛生組織飲用水标準》并沒提到“弱堿性水有利于身體健康”及“小分子團水”的概念。
