教育基地
南京古生物博物館是一個集展覽、收藏、研究和教育于一體的現代化博物館。博物館展覽将兼有科學性、知識性、觀賞性和趣味性，吸引國内外同行和觀衆，成為一個引人入勝的科學旅遊景點和廣大青少年喜愛的科普教育基地。
研究成果
中國科學院南京地質古生物研究所經過幾代古生物學家的艱苦努力和卓越貢獻，湧現了以澄江動物群研究為代表的一大批具有世界先進水平的研究成果，積累了非常豐富的古生物化石。原有的小型古生物陳列室已遠不能反映當前古生物學研究的成果，也無法全面系統地展示地球演變過程中的生命進化史。而南京乃至江蘇長期以來也一直缺乏有關生命進化的自然科學類的博物館。因此，中國古生物學事業需要一個平台來展示古生物學研究的最新成果，全面系統地宣傳生命進化的自然科學知識，社會也需要從古生物學中吸取豐富的有關生命進化的自然科學營養。
博物館建設
上世紀末啟動的中國科學院知識創新工程提出了創新文化的重要内容。作為創新文化重要組成部分的博物館建設成為了院所一緻的認識。中國科學院和江蘇省政府分别撥款3500萬和1000萬，為博物館建設提供了經費保證。
1998年3月，江蘇省與中科院領導在院、省合作會談中，确定中科院和江蘇省合作共建南京古生物博物館。2002年5月博物館土建開工，2004年4月通過博物館建安工程的驗收。
2004年5月啟動博物館布展的設計，招标和施工，并于2004年10月1日對外開放一期工程“澄江動物群特展”，2005年12月底對外開放二期工程“生命進化史展覽”。
總建築面積8500平方米，其中展覽區面積近4200平方米。
展覽特色
三、基本陳列、展覽特色
（一）、生物進化史主題展
1）門廳：大型生命進化浮雕，大型地球儀，“進化中的生命、演變中的地球”主題展台。另包括博物館簡介，展覽内容布局和參觀路線示意圖，總服務台。
2）上山之路：展示南京地區震旦系-侏羅系地層的仿真岩層剖面（鑲有許多南京地區的化石）。
3）化石奧秘：介紹化石定義、化石類型、化石形成、化石作用和達爾文進化論的展牆，大型展台和相間分布的動植物化石以及一些大型古生物化石的展示。
4）前寒武紀：地球在太陽系中的位置展牆，早期地球環境展牆，生命的起源和早期演化油畫展牆和展台，早期火山噴發展牆，最古老岩石展牆和最古老岩石和化石展品，生物的五界分類展牆，甕安生物群展牆和展台，埃迪卡拉動物群展牆和展台。
5）古生代：各紀古地理展牆，梅樹村動物群展牆，澄江動物群景觀櫥窗，寒武紀大爆發展牆，寒武紀、奧陶紀、志留紀、泥盆紀、石炭紀和二疊紀展牆和展台。
6）中生代：三疊紀、侏羅紀和白垩紀展牆和展台，菊石時代展牆和展台，爬行動物和恐龍時代展牆，白垩紀末恐龍絕滅事件展牆。
7）新生代：古近紀、新近紀、第四紀和第四紀氣候展牆、展台以及大型繪畫和大型骨架化石。
（二）、生命進化專題展
1）澄江動物群特展廳：包括主題牆：澄江動物群-揭示寒武紀大爆發的獨特窗口，澄江動物群大型地層剖面，澄江動物群景觀複原圖：寒武紀早期海洋生物世界，奇蝦Anormalocaris等模型，海底景觀隧道，反映澄江動物群生态的三維動畫，放大鏡展牆，複原圖展牆，化石照片展牆等。展出澄江動物群代表性化石：12個大類，80多個種，約240塊标本。
2）恐龍天地：大型岩石地台，知識展台，恐龍景觀箱，侏羅紀和白垩紀恐龍生态模拟岩石，展台。展示了以馬門溪龍，沱江龍、祿豐龍和翼龍構成的群體造型。
3）微觀世界：直徑6m仿顆石藻的圓形展廳，内設顯微鏡四台、投影儀一台。
4）菊石展台，展示震旦紀到第四紀的代表性化石。
5）無脊椎動物化石大觀展牆，展示十一個門類的化石。
6）二疊紀末的生物大滅絕：模型景觀、大型噴繪畫與展台、展牆。
7）恐龍時代的海洋（關嶺生物群）：大型模型景觀，展台。
8）海百合化石幕牆，展示28塊大型海百合化石。
9）熱河生物群：展牆、展台、大型繪畫、大型模型景觀窗。展示以東方葉肢介-狼鳍魚-三尾拟蜉蝣為代表的熱河生物群以及中華龍鳥，孔子鳥，孔子鳥，尾羽鳥，嬌小遼西鳥等
10）鳥類的起源和早期演化：模型景觀和展台。
11）山旺生物群：岩石展台和圖文展台。
12）南京直立人：大型溶洞（湯山猿人洞），展闆。南京直立人頭骨模型和其它古人類頭骨複原模型以及與南京直立人共生的展示，南京直立人在人類演化曆史上的地位等。
13）南京地史演變：展示南京地區地層表和南京地區數字地質圖的展牆，大型南京地形模型。
14）我從哪裡來：大型噴繪，展牆和影象展示。
具體地址
地址：江蘇南京市北京東路39号。市民可乘南京地鐵3号線、南京地鐵4号線至雞鳴寺站，步行前往。
