定義
多核苷酸鍊中由莖區(雙鍊區、螺旋區)和環區(單鍊區)組成的類似于“發夾”狀的結構。常出現在RNA的二級結構中，在蛋白質的二級結構中也有發夾結構。
單鍊體系
當反應體系隻涉及一條“發夾”結構的DNA單鍊時，DNA由三部分組成，分别為可識别靶标分子的适配體、信号分子單元(往往為具有催化能力的DNA酶片段)及對“發夾”結構起穩定作用的尾巴結構組成。在加入待測物時，待測物與其适配體特異性結合，封閉的“發夾”結構被打開，“發夾”結構上的DNA酶片段能夠與氯化高鐵血紅素形成G-四聯體結構，催化H2O2氧化四甲基聯苯胺(TMB)顯色，從而獲得檢測信号[6]。該方法無需使用抗體，DNA序列相對簡單，信号可視化程度高，被廣泛用于小分子的靈敏快速檢測。
雙鍊雜交鍊式反應
當反應體系涉及兩條鍊時，可識别靶标物的适配體與DNA酶片段分别位于H1的5’端和H2的中部；同時，設計H1的3’端堿基與H2的3’端堿基互補，H2的5’端堿基與H1的5’端互補。加入待測物後，待測物與H1的5’端的适配體結合形成待測物與适配體的複合物，使H1的“發夾”結構打開，新暴露的3‘端與H2的3’端堿基互補，使H2的“發夾”結構打開，并暴露出H2的5’端，進一步與H1的5’端發生堿基互補反應，從而實現單一檢測分子引發HCR并形成DNA長鍊。由于每一個H2分子中部的DNA酶片段均可以在血紅素存在時引發H2O2氧化TMB顯色，從而使檢測信号得到級聯放大，提高了檢測的靈敏度。
