选择原则
1、选择天然复合型菌种。
发酵床内是一个很复杂的生态系统，因而无论是单一菌种还是某一两种单一菌种“机械性”组合结合，均远远不能适应发酵床中不同部位不同季节的温度、湿度、通气性、酸碱度等复杂多变情况，运行三两个月后极易造成菌种大部分甚至全军覆没的“死床”现象，使整个发酵床报废，用户的时间及经济损失惨重，经销商与厂家的信誉大损。做发酵床千万不能急功近利，所谓“复合菌种”，决不能用某几个单一菌种机械相加“复合”了事，最好要用天然复合菌种，如EM菌，能“相生不相克”，能相互配合协同作战，而机械型复合的菌种可能导致各菌种内部拮抗、冲突、内耗，失败的风险极大。
2、选择活力强大的菌种。
实验室制作或土法自制的菌种活力较差而且不稳定，此时行彼时不行，此地行彼地不行，三两个月行而半年一年又不行了，南方行的北方又不行等。因而要选专业厂家生产的发酵床专用菌粉，专业公司生产的菌种经过筛选、提纯、复壮等多道工序，菌种功能强大，且性能长期稳定可靠，操作起来一般不会出现因人而异的情况。菌种的剂型要合适，一般来地说，粉剂固体类菌种如发酵床专用菌粉，其休眠功能极好，活力及抗逆性极强，易于保存和运输，常温下可保存三年以上，做好的床几个月不进动物仍可正常启动，同时粉剂型还可以分批次在不同时间转入活化状态进行工作，只有外界条件合适时才从休眠状态转入活化状态，不会因一时条件不适合发酵而导致菌种死亡。
3、选择操作简单的菌种。
如果做床太繁琐、太麻烦，一是时间上耗不起，成本高昂，而且易出错；二是不便于学习和推广传播，不便于经销。用发酵菌种制作发酵床只需要发酵床菌种和垫料，无须其他，只要将菌种按1：5的比例加上麸皮或玉米粉、米糠，不加水混合均匀，再均匀干式撒入垫料中，将垫料铺到50厘米即可，操作真正“傻瓜化”，极易成功，不易失败，也便于经销商代理商进行推广。
4、选择临床实践长的菌种。
要问厂家何时进入这个行业，没个两三年临床实践经验只能算凑热闹不能算入门了，质量稳定更是大问号。在选用一种产品之前先了解一下这个厂家的产品有多少用户，有哪些经销代理商。一般来说，用户越多且分布越广的产品代表性越强，用起来越安全；经销代理商越多、口碑越好的，这个产品越可靠。不象西瓜或口香糖饼干之类的消费品，一吃便知优劣，发酵床产品及相关技术一般要经几年示范推广才能下结论，要经得起市场以及时间的考验，所以选择发酵床产品时不能贪图一时便宜，一定应该谨慎行事，避免受到重大损失。
5、选择媒体报道过的菌种。
真正好的技术和产品总会很快为广大用户所了解，发酵床养殖技术也不例外，而真正的好产品口碑自然不会坏，媒体也会正面进行宣传报道。如果报刊杂志上网站等各种媒体的广告宣传均见不到，向用户或一般百姓打听均说没听见过的，那么，这个厂家或产品可能是新的或很一般的。当然也不能片面听信某些非法小报刊杂志的夸大或欺骗性的宣传，应注意甑别，要选择一些口碑较好影响力较大的媒体来了解这一技术与产品。
6、选择总成本投入最低的。
发酵床的成本包括发酵菌种成本和有机垫料成本，有的技术还包括使用过程的维护成本，选择某项产品时要考虑综合成本，所以不要只听某菌种单价，有的菌种可能不要花钱，但自行生产或制作的时间及成本费用远远高于选购专业菌种。发酵床的制作总成本包括很多方面，应综合计算，如菌种的单价、每平方米的用量、每克有效功能活菌数、菌种的存活时间与添补周期、垫料的易得性与成本费用，配合辅料的种类数量与费用金额、营养液的成本、日常维护的繁简性及费用成本、人工成本、失败风险成本等。有的菌种单价很便宜，但各种营养液、氨基酸、添加剂以及过多过厚的垫料、辅料等等，操作繁琐且不说，其总成本早已让用户不堪重负。在同等品质的情况下，总成本越低、操作越简单的发酵床菌种更具优势。其专业菌种活性强，制作与日常维护均极其简单，无须辅料无需其他营养液，而且养猪垫料只需60--80厘米，鸡鸭鹅等仅需40厘米厚，总成本低而其性价比远优于同类产品，寿命长达3年，是值得用户或经销商信赖的专业品牌。
猪舍设计
猪舍的基本模式是在猪舍背阴处设置1米的人行过道，1.5米宽的水泥饲喂台，水泥饲喂台有向人行过道的倾斜面，防止猪只饮水浪费时污染发酵床。剩下的区域为垫料池。不管是单列式猪舍还是双列式猪舍或者是联合式猪舍，其基本模式都是一样的。建设猪舍是时候，不要像有些厂家宣传的那样不建水泥饲喂饲喂台，不然很难保障猪只可以安全度夏。
场址选择
地理位置
新建猪场，要确定场址的位置，尽量接近饲料产地，有相对好的运输条件。要远离生猪批发市场、屠宰加工企业、风景名胜地和交通要道等。一般要求距离畜产品加工厂至少1km以上；距离主要公路300m以上，距离一般公路100m以上，可设置专用猪场通道与交通要道相联结；且距离最近的村庄最好不少于2km；高压线不得在仔猪舍和保育舍上面通过。
地势与地形
要求地势较高、干燥、平缓、向阳。场址至少高出当地历史洪水水位线以上，其地下水位应在2m以下，这样可以避免洪水的威胁和减少因土壤毛细管水位上升而造成地面潮湿。
土质
要有一定的承载能力，还应透气透水性强，毛细管作用弱，吸湿性和导热性小，质地均匀的土壤。
猪舍朝向
猪舍朝向主要考虑两个方面的因素：一是日照条件——合理利用太阳辐射热量；二是通风条件——合理利用主导风向。
猪舍间距
猪舍的间距主要考虑日照间距、通风间距、防疫间距和防火间距。
垫料池设计
发酵床养猪的核心技术之一就是“发酵床”，可以说，发酵床制作的成功与否，在很大程度上是由垫料池的建设所决定的，也决定了日后的经济效益。
目前垫料池有三种分布模式：一是地上式垫料池，适合地下水位高、雨水容易渗透的地区，管理方便，但地上建筑成本有所增加，发酵床靠近四周的垫料发酵受周围环境影响大；二是地下式垫料池，适合地下水位低、排水通畅、雨水不易渗透的地区，地上的建筑成本较低，发酵效果相对均匀，但需要挖掘发酵床区域泥土；三是半地上半地下式垫料池，结合了地上式、地下式的优点，地上建筑成本和效果也介于二者之间。
针对垫料池的这几种形式，可以利用特殊的地理状况因地制宜的建设，以降低成本。
综述
发酵床养猪技术采用锯末、秸秆、稻壳、米糠、树叶等农林业生产下脚料,配以专门的微生态活性制剂(或叫益生菌制剂)制成垫料,猪在垫料上生活,垫料里的有益微生物能够迅速降解猪的粪尿,无臭味及其他有害气体产生。不需要冲洗猪舍,从而没有任何废弃物排出猪场。猪出栏后,垫料清出圈舍就是优质有机肥,彻底解决了养猪业粪便的污染,是一种零排放、无污染,生态养猪新模式。
