分類标準
截至2013年，對轉基因食品尚無明确分類，根據慣例按不同标準可進行不同分類。
根據轉基因食品中是否含有轉基因源為标準可分為如下三種不同類型：
（1）食品本身不含轉基因的轉基因食品，是指食品盡管來源于轉基因生物，但其産品本身并不會有任何轉移來的基因。
（2）轉基因食品中确實含有轉基因成分，但在加工過程中其特性已發生了改變，轉移來的活性的基因不複存在于轉基因食品中的轉基因食品。
（3）轉基因食品中确實帶有活性的基因成分，人們食用這種轉基因生物或食品後，轉移來的基因和生物本身固有的基因均會被人體消化吸收的轉基因食品。
根據轉基因食品來源的不同可分為如下三種不同類型：
（1）植物性轉基因食品。所謂植物性轉基因食品，是指以含有轉基因的植物為原料的轉基因食品。
（2）動物性轉基因食品。所謂動物性轉基因食品，是指以含有轉基因的動物為原料的轉基因食品。
動物的轉基因食品，主要是利用胚胎移植技術培養生長速率快、抗病能力強、肉質好的動物或動物制品。
（3）微生物轉基因食品。所謂微生物轉基因食品，是指以含有轉基因的微生物為原料的轉基因食品。轉基因微生物食品，主要是利用微生物的相互作用，培養一系列對人類有利的新物種。
根據食品中轉基因的功能的不同大緻可以分成以下6種類型：
（1）增産型的轉基因食品
（2）控熟型的轉基因食品
（3）保健型的轉基因食品
（4）加工型的轉基因食品
（5）高營養型的轉基因食品
（6）新品種型的轉基因食品
代表食物
1、木瓜據悉，市場上賣的95%以上的木瓜都是，這或許出乎很多人的想象。
2、大豆及豆制品（包含大豆油）非轉基因大豆：為橢圓形狀，有點扁。肚臍為淺褐色。豆大小不一。打出來的豆漿為乳白色轉基因大豆：為圓形，滾圓。肚臍為黃色或黃褐色。豆大小差不多。打出來的豆漿有點黃，用此豆制作的豆腐什麼的都有點黃色。
3.胡蘿蔔非轉基因胡蘿蔔：表面凸凹不平，一般不太直，從頭部到尾部是從粗到細的。且頭部是往外凸出來的。轉基因胡蘿蔔：表面相對較光滑，一般是直的，它的尾部有時比中間還粗。且頭部是往内凹的。注：胡蘿蔔隻有在秋冬季節有，夏季的一般是轉基因的。
4、土豆非轉基因土豆：樣子比較難看，一般顔色比較深，表面坑坑窪窪的，同時表皮顔色不規則，削皮之後，其表面很快會顔色變深，皮内為白色。轉基因土豆：表面光滑，坑坑窪窪很淺，顔色比較淡。削皮之後，其表面無明顯變化。檢驗方法：先削皮後看變化再決定吃不吃。
5、西紅柿、聖女果轉基因西紅柿：顔色鮮紅很好看，果實較硬，不易裂。小西紅柿都是轉基因的，有紅的，有黃的，形狀有兩種，一種是橢圓形，還有一種是圓的。非轉基因西紅柿形狀比較大，也有些形狀比較小的。從味道看，非轉基因的有些酸味，轉基因的沒有酸味，是一種半生不熟的甜味，吃過小西紅柿（也叫聖女果）的人都知道這種味道。非轉基因西紅柿成熟以後，捏起來裡面是軟的。轉基因的捏起來發硬。
非轉基因西紅柿不耐儲存，轉基因的放很久都不腐爛。
6、部分水稻及大米在國内取得轉基因大米合法種植權的地區是湖北，要警惕細長的很亮的米。容易與東北“長粒香”混淆。
7、小麥與面粉轉基因小麥籽粒色白透明發亮，全角質，屬硬質強筋優質面包小麥品種，特優轉基因9506小麥2008年在安徽面世，面粉中還有漂白劑、滑石粉混在裡面，就更難識别。
8、玉米及玉米油2011年國内轉基因棉花種植比例高達71.5%，國内批準的國産轉基因棉花品種太多，至少數百。轉基因玉米：甜脆、飽滿、體形優美、頭顆粒尾差不多，俗稱甜玉米，全部進口玉米基本都為轉基因玉米。轉基因玉米油：在超市購買玉米有時，一定要仔細看标簽，是否标有轉基因字樣。
9、菜籽及菜籽油轉基因菜籽出油率高，目前國家已經确認的是黃籽油菜渝黃1号和2号。非轉轉基因菜籽是指我國原先有的一些菜籽品種，這種菜籽産是要低些，出油率低些。
10、白菜及辣椒等大白菜福山大包頭，這是國家目前已經确認含有轉基因的白菜品種。
曆史背景
上世紀80年代，轉基因乙肝疫苗被研制成功。其原理是，将乙肝病毒基因中負責表達表面抗原的那一段“剪切”下來，轉入酵母菌裡。被轉入乙肝病毒基因的酵母菌生長時，就會生産出乙肝表面抗原。
而酵母菌是一種能快速生長繁殖的生物，于是乙肝表面抗原就被大量生産出來。隻後技術接着發展，美國最早對轉基因植物進研究。首例轉基因生物（Genetically Modified Organism，GMO）于1983年問世，轉基因作物（1986）批準進行田間試驗，延熟保鮮番茄（1993）（Calgene公司生産）在美國批準上市，開創了轉基因植物商業應用的先例。
因此賣給消費者的第一種轉基因食物是西紅柿。
國際現狀
美國是轉基因食品最多的國家，60%以上的加工食品含有轉基因成分，90%以上的大豆、50%以上的玉米、小麥是轉基因的。在我國，轉基因食品還比較罕見，到目前為止，經農業部生物工程安全委員會準許商業化的轉基因作物僅有6個，其中有3個涉及食品，即兩種西紅柿、一種甜椒。
但是，随着我國加入WTO的推進和全球一體化的到來，食用轉基因食品将成為不可回避的事實。
那麼，當越來越多的轉基因食品呈現在我們面前時，首當其沖的問題就是：轉基因食品敢吃嗎？消費者能接受嗎？人們食用轉基因食品後，有副作用嗎？持懷疑态度的理由是：害蟲都不敢輕易下口的轉基因作物，一旦變成糧食和農副産品，讓我們一日三餐皆不離，是不是連同那些抗蟲基因也消化了呢？愈來愈耐貯藏的西紅柿會引起人體的變異嗎？
由此，在英國曾發生由抗蟲土豆引起的環保組織狂摔超市中的基因食品、各種媒體紛紛聲讨轉基因食品的事件。美國、加拿大兩國的消費者雖然大多數已接受了轉基因食品，但仍有27%的消費者認為食用轉基因食品可能會對健康造成危害。
在此情況下，轉基因技術（包括轉基因食品）的安全性問題，很快引起人們的極大關注，世界上許多國家都制定了對轉基因生物的管理法規和辦法，負責對其安全性進行評價和監控，其内容主要集中在環境安全性和食用安全性兩方面。
我國正在起草的命名為《中國生物安全國家框架》的法規，規定了本着對全人類和子孫後代長遠利益負責的态度，從生物安全性問題的廣泛性、潛在性、長期性、嚴重性上做好生物安全管理工作，同時要求對進口的轉基因食品進行嚴格的安全檢測，真正确保消費者的利益。
曾參與英國“多利羊”的克隆工作，十幾年來一直從事基因工程方面研究的中國農業大學食品學院院長、博士生導師羅雲波教授認為，從本質上講，轉基因生物和常規育成的品種是一樣的，兩者都是在原有的基礎上對某些性狀進行修飾，或增加新性狀，或消除原有不利性狀。
雖然，目前的科學水平還不能完全精确地預測一個外源基因在新的遺傳背景中産生什麼樣的相互作用，但從理論上講，轉基因食品是安全的。對長期食用轉基因食品是否有副作用的問題，羅教授認為是不會的，一是因為轉基因食品上市之前是經過大量試驗和許多部門嚴格檢驗的；二是轉基因食品在體内不積累。總之，轉基因食品的前景是樂觀的。
至于消費者能不能接受轉基因食品，國際消費者聯合會主席陳黃穗介紹，為保護消費者，國際消聯向聯合國食品委員會建議：轉基因食品應有标識，讓消費者明明白白地知道食品是否含有轉基因，由他們自己決定是否選擇這類食品。
國内現狀
2006年3月20日開始實施的《農業轉基因生物标識管理辦法》，隻要求被列入目錄的轉基因生物産品必須進行标識。
在一些超市中發現，很少有食品标注“轉基因産品”或“以轉基因原料制成”等标識。
有些産品倒是在精美的标簽上印了“不含膽固醇”等字樣。巧克力、蕃茄醬等可能含有轉基因成分的食品，也隻是在标簽中印上了“不含防腐劑”、“不含黃曲黴素”。轉基因食品對許多消費者來說是一個新生事物，很多人對此還沒有一個科學的認識，對轉基因食品的安全性能有一種恐懼感。商家如果貼出轉基因标識，可能對自身銷量有影響。
相關謠言
人們懷疑食用轉基因食物會給身體帶來一些不好的後果，比如緻癌、不育等等。
這幾年，轉基因食品安全性問題備受社會關注。作為一項生物新技術，轉基因在國内的發展之路可謂曲折坎坷。網絡上，關于轉基因的口水戰此起彼伏，有關轉基因食品的各色謠言漫天飛。在這樣的輿論環境中，有的企業利用部分消費者對轉基因技術的認知欠缺和焦慮心理，為追求自身利益而不顧市場規則，把“非轉基因”作為賣點加以炒作。
這種做法違背了廣告法等相關法規，其結果不僅導緻行業競争的無序，更加劇公衆對于轉基因技術的恐慌情緒。轉基因與非轉基因商戰的背後，是企業的利益之争，與轉基因食品安全性并無本質關聯。但這樣一場商戰，卻付出了慘痛的代價——它打破了行業間公平競争的市場環境，助長了各類“妖魔化”轉基因謠言的傳播，給轉基因技術的研發應用設下重重障礙。
目前在世界科學界沒有研究表明轉基因食品對人體有害。事實上，在我國，轉基因食品的安全性也是有定論的。2014年6月，國家農業轉基因生物安全管理部際聯席會議辦公室聯合中國科協科普部，編印了《理性看待轉基因》科普讀本，讀本中指出“國際組織、發達國家和我國開展了大量的科學研究，均認為上市的轉基因食品與傳統食品同樣安全。”
也就是說，凡是通過轉基因安全評價，獲得安全證書，進入市場的轉基因食品都是安全的。
